Genomic developments har bemyndigat undersökningen av heritability in wild populations direkt från genomewide relatedness matrices (GRM). Sådana GRM – baserade metoder kan i synnerhet användas för att förbättra eller ersätta metoder baserade på social stamtavla (PED-social)., Att mäta heritability från GRM i naturen har dock inte tillämpats i stor utsträckning än, särskilt med små prover och i icke-modellarter. Här uppskattade vi heritability för fyra kvantitativa egenskaper (tarsus längd, vinglängd, bill längd och kroppsmassa), med hjälp av PED-social, en stamtavla korrigerad av genetiska data (PED-korrigerad) och en GRM från ett litet prov (n = 494) av blå Tuttar från naturliga populationer i Korsika genotypad vid nästan 50 000 filtrerade SNPs härrörande från RAD-seq. Vi mätte också genetiska korrelationer bland drag, och vi utförde kromosomavdelning., Uppskattningarna av ärftlighet var något högre när GRM användes jämfört med PED-social, och PED-korrigerade gav mellanliggande värden, vilket tyder på en mindre underskattning av heritability i PED-social på grund av felaktiga stamtavla länkar, inklusive extrapar faderskap, och att sänka informationsinnehållet än GRM. Genetiska korrelationer mellan drag var likartade mellan PED-social och GRM men trovärdiga intervall var mycket stora i båda fallen, vilket tyder på brist på makt för denna lilla datauppsättning., Även om ett positivt linjärt förhållande hittades mellan antalet gener per kromosom och kromosom heritability för tarsus längd, visade kromosompartitionering på samma sätt en brist på kraft för de tre andra egenskaperna. Vi diskuterar användbarheten och begränsningarna av de kvantitativa genetiska inferenserna baserat på genomiska data i små prover från vilda populationer.
Lämna ett svar