de portugisiska upptäcktsresorna öppnade vägen för direkta kontakter mellan den katolska kyrkan och den etiopiska ortodoxa kyrkan. På 1300-talet kom katolska missionärer i Etiopien. Den 28 augusti 1439 skickade påven Eugene IV ett budskap om enighet med den katolska kyrkan till den etiopiska kejsaren Konstantin I, men denna ansträngning misslyckades.

med islamiska attacker upp till 1531 hotar kristna Etiopien, en vädjan från kejsaren till portugisiska förde stöd för att besegra Adal sultanatet i etiopiska–Adal kriget., Jesuit missionärer kom med portugisiska till Etiopien. Dessa missionärer fokuserade sin omvändelseverksamhet på landets styrande klass, inklusive kejsaren, för att få den etiopiska ortodoxa kyrkan att förena sig med den katolska kyrkan. Kejsaren Susenyos omvandlades främst av Fader Pedro Páez. År 1622 gjorde Susenyos katolicismen till statsreligion. Nästa år, Påven Gregorius XV heter Afonso Mendes, en portugisisk Jesuit, Patriark av den Etiopiska Kyrkan. En formell union år 1626 förklarades när patriark Mendes kom till landet., Med Mendes som försökte latinisera den etiopiska kyrkan använde Susenyos kraft för att införa Latiniseringen. Offentliga bakslag resulterade. År 1632 dog Susenyos. Hans efterträdare Fasilides 1636 tog bort Mendes från landet, avslutade facket med Rom och avlägsnade eller dödade de återstående missionärerna. Under de kommande 200 åren stängdes Etiopien för katolska uppdrag.

1839 anlände italienska lazaristiska och Capuchins missionärer, om än inom vissa begränsningar som ålagts dem på grund av stark offentlig opposition., Samma år utsågs Justin De Jacobis till förste prefekt apostolisk av Abessinien och anförtroddes grunden för katolska uppdrag i det landet. Efter att ha arbetat med stor framgång i Abessinien i åtta år, utsågs han till titulär biskop av Nilopolis 1847, och kort därefter kyrkoherde apostoliska Abessinien, men han vägrade episkopal värdighet tills den slutligen tvingades på honom 1849.

år 1919 grundades den påvliga Etiopiska Högskolan inom Vatikanens väggar av påven Benedict XV med Stefans kyrka, bakom st., Peterskyrkan, som den utsedda kyrkan för Högskolan.

den latinska kyrkan hade blivit etablerad i södra Etiopien i områden som inte hade varit kristna och som införlivades i det moderna landet först i slutet av 1800-talet. Den italienska ockupationen av Etiopien 1936 gav upphov till en ökning av antalet Latin-kyrkan jurisdiktioner, men utvisningen av utländska missionärer i slutet av andra världskriget innebar att den etiopiska riten präster måste ta ansvar för områden som därmed förnekas katolska präster., Följaktligen bildades 1951 Den etiopiska riten apostoliska Exarkatet av Addis Abeba, och den vanliga för Eritrea höjdes till rangen av exarkat. Tio år senare, den 20 februari 1961, en Etiopisk kyrkliga provinsen bildades, med Addis Abeba Metropolitan Se och Asmara (Eritrea) och Adigrat (i Etiopien) som suffragan eparchies.

1995 grundades två nya eparchies, Barentu och Keren, i Eritrea, och den latinska kyrkans apostoliska kyrkoherde avskaffades., Eritrea blev därmed det enda land där alla katoliker, oavsett kyrkan av deras kanoniska uppskrivning, tillhör en öst katolsk jurisdiktion. År 2003 skapades ytterligare en eparchy i Endibir I Södra Nationerna, nationaliteterna och folkens Region i Etiopien.

i januari 2015 etablerade påven Francis den eritreanska Katolska kyrkan som en sui iuris öst katolska kyrka, vilket ger den autonomi från den etiopiska Katolska Kyrkan.

det finns också latinska kyrkans jurisdiktioner i södra Etiopien, ingen av dem höjde sig till stiftet., Åtta är apostoliska vicariater och en är en apostolisk prefektur.