Die Energie für den Putsch verpuffte Ende August, und die Kennedy-Regierung gab sich der Zusammenarbeit mit Diem hin und drängte ihn zu einer Reihe politischer, wirtschaftlicher, militärischer und sozialer Reformen, die die Bemühungen zur Aufstandsbekämpfung verbessern sollten. Aber Ende Oktober kämpfte Präsident Kennedy erneut mit der Möglichkeit eines Putsches und was die Vereinigten Staaten dagegen tun sollten. Seine Berater waren gespalten. Oktober hörte Kennedy mehrere Meinungen, die in einem Memorandum des Gesprächs klar zusammengefasst waren.,

Außenminister Dean Rusk schlug vor: „Wir sollten die Generäle warnen, dass sie die Situation in der Hand haben müssen, bevor sie einen Putsch starten.“

„Sekretär McNamara“, notierte das Memo, “ fragte, wer von unseren Beamten in Saigon für die Putschplanung verantwortlich ist.“

Generalstaatsanwalt Robert Kennedy äußerte seine Zweifel am Bruch mit Diem:

Averell Harriman, Staatssekretär für politische Angelegenheiten, sagte, es sei klar, dass es in Vietnam immer weniger Begeisterung für Diem gebe., Wir können nicht vorhersagen, dass die Rebellengeneräle die Diem-Regierung stürzen können, aber Diem kann das Land nicht zum Sieg über die Viet Cong führen. Im Laufe der Zeit werden unsere Ziele in Vietnam mit Diem in Control immer schwieriger zu erreichen sein.“

Am 1. November wurden diese Bewertungen strittig, als eine Gruppe vietnamesischer Armeeoffiziere, angeführt von General Duong Van Minh, Diem und Nhu ermordete. Am Morgen des 2.November las McGeorge Bundy dem Präsidenten Berichte über den Putsch vor.