Die portugiesischen Entdeckungsreisen eröffneten den Weg für direkte Kontakte zwischen der katholischen Kirche und der äthiopisch-orthodoxen Kirche. Jahrhundert kamen katholische Missionare in Äthiopien an. August 1439 sandte Papst Eugen IV. eine Botschaft der Einheit mit der katholischen Kirche an den äthiopischen Kaiser Konstantin I., aber diese Bemühungen waren erfolglos.

Mit islamischen Angriffen bis 1531, die das christliche Äthiopien bedrohten, brachte ein Appell des Kaisers an die Portugiesen Unterstützung, um das Adal–Sultanat im äthiopisch-Adal-Krieg zu besiegen., Jesuitenmissionare kamen mit den Portugiesen nach Äthiopien. Diese Missionare konzentrierten ihre Bekehrungsaktivitäten auf die Regierungsklasse des Landes, einschließlich des Kaisers, um die äthiopisch-orthodoxe Kirche mit der katholischen Kirche zu vereinen. Der Kaiser Susenyos wurde vor allem von Pater Pedro Páez bekehrt. 1622 machte Susenyos den Katholizismus zur Staatsreligion. Im nächsten Jahr nannte Papst Gregor XV Afonso Mendes, einen portugiesischen Jesuiten, Patriarchen der äthiopischen Kirche. Eine formelle Vereinigung wurde 1626 erklärt, als Patriarch Mendes ins Land kam., Mit Mendes versucht, die äthiopische Kirche latinisieren, Susenyos verwendet Kraft, um die Latinisierung aufzuzwingen. Öffentliche Gegenreaktion führte. 1632 starb Susenyos. Sein Nachfolger Fasilides entfernte 1636 Mendes aus dem Land, beendete die Vereinigung mit Rom und entfernte oder tötete die verbleibenden Missionare. Für die nächsten 200 Jahre war Äthiopien für katholische Missionen geschlossen.

1839 trafen italienische Lazaristen-und Kapuzinermissionare ein, wenn auch innerhalb bestimmter Grenzen, die ihnen aufgrund starker öffentlicher Opposition auferlegt wurden., Im selben Jahr wurde Justin de Jacobis zum ersten apostolischen Präfekt von Abessinien ernannt und mit der Gründung katholischer Missionen in diesem Land betraut. Nachdem er acht Jahre lang mit großem Erfolg in Abessinien gearbeitet hatte, wurde er 1847 zum Titularbischof von Nilopolis und kurz darauf zum apostolischen Vikar von Abessinien ernannt, lehnte jedoch die bischöfliche Würde ab, bis sie ihm 1849 schließlich aufgezwungen wurde.

Das Päpstliche Äthiopische Kolleg wurde 1919 von Papst Benedikt XVI. mit der Stephanskirche hinter der St., Petersdom, als designierte Kirche für das College.

Die lateinische Kirche hatte sich im Süden Äthiopiens in Gebieten etabliert, die nicht christlich waren und erst Ende des 19. Die italienische Besetzung Äthiopiens im Jahr 1936 führte zu einer Zunahme der lateinisch-kirchlichen Gerichtsbarkeiten, aber die Vertreibung ausländischer Missionare am Ende des Zweiten Weltkriegs bedeutete, dass der äthiopische Ritus Klerus die Verantwortung für Gebiete übernehmen musste, die so von katholischen Geistlichen entweiht wurden., Dementsprechend wurde 1951 das äthiopische Apostolische Exarchat von Addis Abeba gegründet und das Ordinariat für Eritrea in den Rang eines Exarchats erhoben. Februar 1961, wurde eine äthiopische Kirchenprovinz mit Addis Abeba als Metropolitan See und Asmara (in Eritrea) und Adigrat (in Äthiopien) als Suffraganbistum Eparchies gegründet.

1995 wurden in Eritrea zwei neue Eparchien, Barentu und Keren, gegründet und das apostolische Vikariat der lateinischen Kirche abgeschafft., Eritrea wurde somit das einzige Land, in dem alle Katholiken, unabhängig von der Kirche ihrer kanonischen Bezeichnung, einer ostkatholischen Gerichtsbarkeit angehören. Im Jahr 2003 wurde in Endibir in der Region der südlichen Nationen, Nationalitäten und Völker Äthiopiens ein weiterer Eparchy gegründet.

Im Januar 2015 gründete Papst Franziskus die eritreische katholische Kirche als sui iuris ostkatholische Kirche und gewährte ihr damit Autonomie von der äthiopisch-katholischen Kirche.

Im Süden Äthiopiens gibt es auch lateinische Kirchengerichte, von denen keine in den Rang einer Diözese erhoben wurde., Acht sind apostolische Vikariate und einer ist eine apostolische Präfektur.