Genomic developments have empowered the investigation of heritability in wild populations directly from genomewide relatedness matrices (GRM). Takie podejście oparte na GRM można w szczególności wykorzystać do poprawy lub zastąpienia podejścia opartego na rodowodzie społecznym (PED-social)., Jednak pomiar dziedziczności GRM na wolności nie był jeszcze szeroko stosowany, zwłaszcza przy użyciu małych próbek i u gatunków niemodelnych. W tym miejscu oszacowaliśmy dziedziczność czterech cech ilościowych (długość Tarsu, długość skrzydła, długość rachunku i masa ciała), używając PED-social, rodowodu skorygowanego danymi genetycznymi (PED-corrected) i GRM z małej próbki (n = 494) niebieskich cycków z naturalnych populacji Korsyki genotypowanych na prawie 50 000 filtrowanych SNP pochodzących z RAD-seq. Mierzyliśmy również korelacje genetyczne między cechami i wykonywaliśmy podział chromosomów., Szacunki Heritability były nieco wyższe przy użyciu GRM w porównaniu do PED-social, a PED-corrected dawały wartości pośrednie, sugerując niewielkie niedoszacowanie heritability w PED-social z powodu nieprawidłowych linków rodowodowych, w tym ojcostwa pozapartyjnego, i niższej zawartości informacji niż GRM. Korelacje genetyczne między cechami były podobne między PED-social I GRM, ale wiarygodne interwały były bardzo duże w obu przypadkach, co sugeruje brak mocy dla tego małego zestawu danych., Chociaż stwierdzono dodatnią zależność liniową między liczbą genów na chromosom a dziedzicznością chromosomów dla długości Tarsu, podział chromosomów podobnie wykazał brak mocy dla trzech innych cech. Omawiamy przydatność i ograniczenia ilościowych wnioskowań genetycznych opartych na danych genomowych w małych próbkach z dzikich populacji.
Dodaj komentarz