in 1939 werd Spencer een van ‘ s werelds toonaangevende experts in het ontwerpen van radarbuizen. Spencer werkte bij Raytheon, een aannemer voor het Amerikaanse Ministerie van Defensie, als hoofd van de power tube division. Tijdens zijn werk bij Raytheon ontwikkelde Spencer een efficiëntere manier om magnetrons te produceren, waardoor de productie steeg van 100 tot 2600 magnetrons per dag. Met zijn reputatie en expertise, slaagde Spencer erin om Raytheon te helpen een overheidscontract te winnen voor het ontwikkelen en produceren van gevechtsradarapparatuur voor M. I. T. ‘ s Stralingslaboratorium., Dit was van groot belang voor de geallieerden van de Tweede Wereldoorlog en werd het tweede hoogste prioriteit project van het leger tijdens de Tweede Wereldoorlog, achter het Manhattan Project. Voor zijn werk ontving hij de Distinguished Public Service Award van de Amerikaanse Marine.op een dag, terwijl hij magnetrons bouwde, stond Spencer voor een actieve radarset toen hij merkte dat de reep die hij in zijn zak had gesmolten was. Spencer was niet de eerste om dit fenomeen op te merken, maar hij was de eerste om het te onderzoeken., Hij besloot om te experimenteren met voedsel, waaronder popcorn kernels, die ‘ s werelds eerste magnetron popcorn werd. In een ander experiment werd een ei in een theeketel geplaatst, en de magnetron werd er direct boven geplaatst. Het resultaat was dat het ei explodeerde in het gezicht van een van zijn collega ‘ s, die in de ketel keek om te observeren. Spencer creëerde vervolgens de eerste echte Magnetron door een high-density elektromagnetisch veld generator aan een gesloten metalen doos te bevestigen. De magnetron uitgezonden microgolven in de metalen doos blokkeren elke ontsnapping, waardoor voor gecontroleerde en veilige experimenten., Vervolgens plaatste hij verschillende voedselproducten in de doos, terwijl hij de effecten observeerde en de temperaturen in de gaten hield.Raytheon diende op 8 oktober 1945 een Amerikaans patent in voor een microgolfoven, die uiteindelijk de naam Radarange kreeg. In 1947, de eerste commercieel geproduceerde magnetron was ongeveer 6 voet hoog, woog ongeveer 750 lbs, en kosten ongeveer $5.000 USD. In 1967 was de eerste relatief betaalbare ($495) en redelijk grote (counter-top) magnetron beschikbaar voor verkoop.Spencer werd Senior Vice President en een Senior lid van de Raad van bestuur van Raytheon., Hij ontving 300 patenten tijdens zijn carrière en een gebouw aan het Raytheon Missile Defense Center in Woburn, Massachusetts, is naar hem vernoemd. Andere prestaties en prijzen, naast de Distinguished Public Service Award, omvatten een lidmaatschap van het Institute of Radio Engineers, Fellowship in de American Academy of Arts and Sciences, en een eredoctoraat in de wetenschap van de Universiteit van Massachusetts, ondanks het hebben van geen formeel onderwijs.voor zijn uitvinding ontving Spencer geen royalty ‘ s, maar hij kreeg eenmalig $2.,00 gratuity van Raytheon, dezelfde token betaling het bedrijf gedaan aan alle uitvinders op zijn loonlijst op dat moment voor bedrijf patenten.