genomische ontwikkelingen hebben het onderzoek van erfelijkheid in wilde populaties mogelijk gemaakt rechtstreeks uit genomewide relatedness matrices (GRM). Dergelijke GRM-gebaseerde benaderingen kunnen met name worden gebruikt om benaderingen op basis van sociale stamboom (PED-social) te verbeteren of te vervangen., Echter, het meten van erfelijkheid van GRM in het wild is nog niet op grote schaal toegepast, vooral met behulp van kleine monsters en in niet-Model soorten. Hier schatten we de erfelijkheid voor vier kwantitatieve kenmerken (tarsus lengte, vleugellengte, snavellengte en lichaamsmassa), met behulp van PED-social, een stamboom gecorrigeerd door genetische gegevens (PED-gecorrigeerd) en een GRM uit een kleine steekproef (n = 494) van pimpelmezen uit natuurlijke populaties in Corsica genotypeerd op bijna 50.000 gefilterde SNPs afgeleid van RAD-seq. We hebben ook genetische correlaties tussen eigenschappen gemeten, en we hebben chromosoompartitionering uitgevoerd., Erfelijkheid schattingen waren iets hoger bij het gebruik van GRM in vergelijking met PED-social, en PED-gecorrigeerde leverde tussenliggende waarden, suggereert een kleine onderschatting van erfelijkheid in PED-social als gevolg van onjuiste stamboom links, met inbegrip van extra-pair vaderschap, en lagere informatie-inhoud dan de GRM. De genetische correlaties tussen eigenschappen waren gelijkaardig tussen PED-sociaal en GRM maar geloofwaardige intervallen waren zeer groot in beide gevallen, die een gebrek aan macht voor deze kleine gegevensreeks suggereren., Hoewel een positieve lineaire relatie werd gevonden tussen het aantal genen per chromosoom en de chromosoom erfelijkheid voor tarsus lengte, chromosoom partitionering toonde ook een gebrek aan kracht voor de drie andere eigenschappen. We bespreken het nut en de beperkingen van de kwantitatieve genetische gevolgtrekkingen op basis van genomische gegevens in kleine monsters van wilde populaties.
Geef een reactie