Como um sábio e respeitado Mestre Jedi, Qui-Gon Jinn certamente teria sido nomeado para o Conselho Jedi se ele não tivesse rotineiramente ido contra a sua vontade. A recusa de Qui-Gon em cumprir as decisões do Conselho era muitas vezes vista como desafio, mas para ele as coisas eram mais simples: sua maior lealdade era à vontade da força, e ele tinha passado anos aprendendo a ouvir seus comandos. Qui-Gon sentiu a força viva no trabalho quando sua missão diplomática a Naboo falhou e ele foi forçado a acompanhar Padmé Amidala para o mundo controlado pelos Hutt de Tatooine., Lá, ele descobriu Anakin Skywalker, um rapaz com enorme força na força. Qui-Gon acreditava que Anakin era o escolhido, profetizado para trazer equilíbrio à força, e que seu encontro não foi um acidente. Ele trouxe Anakin para o Conselho Jedi em Coruscant, e ficou furioso quando seus companheiros mestres se recusaram a treinar o menino, mas viu sua falta de visão como apenas um revés temporário. O aprendiz de Sith Darth Maul atacou Qui-Gon durante a batalha por Naboo, mas os mortalmente feridos Jedi viveram o suficiente para pedir a seu Padawan, Obi-Wan Kenobi, que prometesse treinar Anakin., Ele passou para a força convencido de que o escolhido tinha sido encontrado e eventos importantes em movimento.