ポルトガルの発見の航海は、カトリック教会とエチオピア正教会の間の直接的な接触の道を開いた。 14世紀、カトリックの宣教師がエチオピアに到着した。 28August1439、教皇Eugene IVはエチオピア皇帝コンスタンティヌスIにカトリック教会との統一のメッセージを送ったが、この努力は失敗した。

1531年までのイスラム教の攻撃により、キリスト教のエチオピアを脅かし、皇帝からポルトガルへの訴えは、エチオピア–アダル戦争でアダル-スルターン朝を打ち負かすための支援をもたらした。, イエズス会の宣教師たポルトガルのエチオピア. これらの宣教師は、エチオピア正教会をカトリック教会と結びつけるために、皇帝を含む国の支配階級に改宗活動を集中させました。 スセニョス皇帝は主にペドロ-パエス神父によって改宗された。 1622年、スセニョスはカトリックを国教とした。 翌年、教皇グレゴリーXVは、ポルトガルのイエズス会士であり、エチオピア教会の総主教であるアフォンソ-メンデスに名前を付けた。 1626年の正式な組合は、総主教メンデスが国に来たときに宣言されました。, メンデスがエチオピアの教会をラテン化しようとしていたため、スセニョスはラテン化を強制するために力を使った。 公共の反発は結果として生じた。 1632年、スセニョスは死去した。 彼の後継者ファシリデスは1636年にメンデスを国から取り除き、ローマとの連合を終わらせ、残りの宣教師を取り除くか殺した。 その後の200年間、エチオピアはカトリックの伝道所に閉じ込められた。

1839年、イタリアのラザリストとカプチンスの宣教師が到着したが、強い世論の反対のために彼らに課された一定の制限の範囲内であった。, 同年、ジャスティン-デ-ジャコビスはアビシニアの最初の使徒頭に任命され、その国のカトリック伝道部の基礎を委託されました。 1847年にニロポリスの司教に任命され、その後まもなくアビシニアの使徒牧師に任命されたが、1849年に最終的に彼に強制されるまで聖公会の尊厳を拒否した。

1919年、教皇ベネディクトXVによってバチカンの壁の中に聖シュテファン教会が設立されました。, ピエトロ大聖堂、大学のための指定された教会として。

エチオピア南部には、キリスト教ではなく、19世紀末に近代国家に組み込まれた地域でラテン教会が設立されていた。 1936年にイタリアがエチオピアを占領したことにより、ラテン教会管轄区域の数が増加したが、第二次世界大戦末期に外国人宣教師が追放されたことは、エチオピアの儀式の聖職者がカトリック聖職者の裸である地域に対して責任を負わなければならなかったことを意味した。, そのため、1951年にはエチオピアの儀式アディスアベバ使徒行伝が設立され、エリトリアの普通教会司令官は元教会司令官の階級に昇格した。 それから20年後の1961年には、アディスアベバが首都として、アスマラ（エリトリア）とアディグラト（エチオピア）が首都として設立された。

1995年、エリトリアにBarentuとKerenの二つの新しいeparchiesが設立され、ラテン教会使徒の代理人は廃止されました。, エリトリアはこのように、すべてのカトリック教徒が、彼らの正典的な帰属教会のどんな教会でも、東部のカトリック管轄に属する唯一の国となった。 2003年には、エチオピア南部のエンディビルでもう一つのeparchyが作成されました。

2015年、教皇フランシスコはエリトリア-カトリック教会をsui iuris Eastern Catholic Churchとして設立し、エチオピア-カトリック教会からの自治を認めた。

エチオピア南部にはラテン教会管轄区域もあり、いずれも教区の階級に上げられていない。, 八つは使徒牧師であり、一つは使徒県です。