Jopa keskellä nämä ennennäkemätön voittaa, kuitenkin, Pekonia ei ilman hänen virheitä. Hän päästi Berkeleyn lähtemään Jamestownista intiaanien yllätyshyökkäyksen jälkeen läheiselle asutukselle. Hän myös takavarikoi gloucesterilta tarvikkeita ja jätti ne alttiiksi mahdollisille Intiaanihyökkäyksille., Pian välittömän kriisin laannuttua Berkeley vetäytyi hetkeksi kotiinsa Green Springsiin ja pesi kätensä koko sotkusta. Nathaniel Bacon hallitsi Jamestownia heinäkuusta syyskuuhun 1676. Tänä aikana, Berkeley ei tullut ulos hänen uupumus ja yrittää vallankaappausta, mutta tuki Bacon oli vielä liian vahva ja Berkeley oli pakko paeta Accomack County itärannalla.,
Tunne, että se tekisi hänen riemuvoitto täydellinen, Pekonia antoi hänen ”Julistuksen Ihmiset” on 30. heinäkuuta 1676, joka totesi, että Berkeley oli vioittunut, pelataan suosikit ja suojattu Intiaanit omiin itsekkäisiin tarkoituksiin. Pekoni antoi myös hänen valan, joka tarvitaan swearer lupaa uskollisuutensa Pekonia millään tavalla tarpeen (ts, armed palvelu, tarvikkeet, kielellinen tuki). Edes tämä tiukka ohjastus ei voinut estää vuorovettä muuttumasta uudelleen. Baconin laivasto oli ensin ja lopulta salaa Berkeleyn miesten soluttautuneena ja lopulta vangittuna., Tästä piti tulla konfliktin käännekohta, sillä Berkeley oli jälleen tarpeeksi vahva vallatakseen Jamestownin takaisin. Tämän jälkeen Bacon seurasi uppoavaa omaisuuttaan Jamestowniin ja näki sen vahvasti linnoitettuna. Hän teki useita yrityksiä piiritys, jonka aikana hän sieppasi vaimot useita Berkeley on suurin kannattajia, mukaan lukien Rouva Nathaniel Pekonia Vanhempi, ja asetti heidät valleilla hänen piirityksen linnoituksia, kun hän kaivoi hänen asemaansa. Raivostunut pekoni poltti Jamestownin maan tasalle 19. syyskuuta 1676. (Hän pelasti monia arvokkaita levyjä valtiopäivillä.,) Tähän mennessä hänen onnensa oli selvästi loppunut tällä äärimmäisellä toimenpiteellä ja hänellä alkoi olla vaikeuksia hallita miestensä käyttäytymistä sekä pitää kansan tukensa. Harva vastasi Pekonia valitus kaapata Berkeley, joka oli sittemmin palannut itärannalla turvallisuussyistä.
26.lokakuuta 1676 Bacon kuoli äkillisesti ”Bloodie Flux” – ja ”Lousey Disease” (body lice) – tauteihin. On mahdollista, että hänen sotilaansa polttivat hänen saastuneen ruumiinsa, koska sitä ei koskaan löydetty., (Hänen kuolemansa inspiroi tätä pikku ditty; Bacon on kuollut olen pahoillani minun hart että täitä ja flux pitäisi ottaa pyövelin osa”.)
pian Baconin kuoleman jälkeen Berkeley sai täydellisen hallinnan ja hirtti kapinan suuret johtajat. Hän myös takavarikoi kapinallisten omaisuutta ilman oikeudenkäyntiä. Kaikkiaan kaksikymmentäkolme henkeä hirtettiin heidän osaltaan kapinassa. Myöhemmin, kun tutkitaan komitean Englannista antoi raporttinsa Kuningas Kaarle II, Berkeley oli helpottunut Governorship ja palasi Englantiin, jossa hän kuoli heinäkuussa 1677.,
näin päättyi yksi Jamestownin historian erikoisimmista ja monimutkaisimmista luvuista. Olisiko se voitu estää vai olisiko ollut aika tehdä väistämättömiä muutoksia siirtomaahallinnon rakenteessa? On selvää, että lait eivät enää olleet voimassa niin pitkälle kuin selkeiden politiikkojen käsitellä ongelmia tai istuttaa uusi elinehto, osaksi siirtomaa taloudessa. Siirtokuntaan ennen kapinaa osuneet lukuisat ongelmat synnyttivät Nathaniel Baconin luonteen., Kansannousun luonteen vuoksi Baconin kapina näyttää ensi silmäyksellä olevan Amerikan itsenäistymispyrkimysten alku. Mutta tosiasioiden tarkempi tarkastelu paljastaa, mitä se todellisuudessa oli: kahden hyvin vahvan persoonan välinen valtataistelu. Heidän välillään he melkein tuhosivat Jamestownin.
Vastaa