tietokanta ja päätelmät

tietokanta. Täydentävä Taulukko S1 luettelot 10 ominaisuudet kunkin 25 tärkeää ’leuto’ (15) ja ’trooppinen’ (10) sairaudet (ks. Täydentävä Huomautus S3 lisätietoja tämän eron). Tavoitteenamme oli valita hyvin määritelty aiheuttavat sairaudet korkein kuolleisuus ja/tai sairastuvuutta ja siten korkein historiallinen ja evolutiivinen merkitys (ks. Täydentävä Huomautus S1 lisätietoja meidän valintaperusteet)., 25 sairaudesta valitsimme 17, koska ne ovat Lopezin ym.arvioimia. (2005) määrätä raskain maailman taakkaa tänään (heillä on korkein vammaisuuteen elinvuosina (DALY) tulokset). 17 sairauksia, 8 ovat lauhkean (hepatiitti B, influenssa, tuhkarokko -, hinkuyskä -, rotavirus -, kuppa -, jäykkäkouristus-ja tuberkuloosi), ja 9 ovat trooppisia (hankittu immuunikato-oireyhtymä (AIDS), Chagasin tauti, kolera, dengue-verenvuotokuume -, Itä-ja Länsi-Afrikan nukkuminen sairauksia, falciparum-ja vivax malarias, ja viskeraalinen leishmaniaasi).,

valitsimme kahdeksan muuta (lauhkea kurkkumätä, sikotauti, rutto, vihurirokko, isorokko, lavantauti ja pilkkukuume, sekä trooppinen keltainen kuume), koska ne käyttöön raskaita taakkoja aiemmin, vaikka nykyaikainen lääketiede ja kansanterveyden on joko hävittää ne (isorokko) tai vähentää niiden rasitusta. Lukuun ottamatta aidsia, denguekuumetta ja koleraa, jotka ovat levinneet ja saavuttaneet maailmanlaajuisen vaikutuksen nykyaikana, useimmat näistä 25 taudista ovat olleet tärkeitä yli kahden vuosisadan ajan.

ovatko johtopäätöksemme vankat näiden valintaperusteiden vaihtelulle?, Noin kymmenkunta sairauksia korkein moderni tai historiallisia rasitteita (esimerkiksi AIDS -, malaria, rutto, isorokko), ei voi olla epäilystäkään siitä, että ne on mukana, mutta joku voisi keskustella joitakin ensi valintoja. Siksi olemme laati kolme vaihtoehtoista sarjaa sairauksia jakaminen ensimmäinen luettelo 16 kiistaton merkittäviä sairauksia, mutta eri ensi valintoja, ja meidän on suorittaa kaikki 10-analyysit on kuvattu alla kaikki kolme sarjaa., Kävi ilmi, että yksi pieni poikkeus, kolme sarjaa tuotti laadullisesti samat päätelmät 10-analyysejä, vaikka eroavat toisistaan niiden tasoa tilastollinen merkitsevyys (ks. Täydentävä Huomautus S4). Johtopäätöksemme näyttävät siis olevan vankat.

lauhkeat / trooppiset erot. Vertailuja näiden lauhkean ja trooppisten tautien tuotto seuraavat päätelmät:

  • suurempi osuus sairauksia levittävien hyönteisten välityksellä tropiikissa (8/10) kuin lauhkean vyöhykkeen (2/15) (P < 0.005, χ2-testi, vapausasteet, d.,f. = 1). Ero voi liittyä osittain lauhkean hyönteistoiminnan kausittaiseen lopettamiseen tai vähenemiseen.
  • suurempi osuus (P = 0, 009) sairauksien välittää pitkäkestoinen immuniteetti (11/15) lauhkeilla alueilla kuin tropiikissa (2/10).
  • Eläinten säiliöt ovat useammin (P < 0.005) tropiikissa (8/10) kuin lauhkean vyöhykkeen (3/15). Ero on käänteisessä suunnassa (P = 0.,1, NS, ei merkitsevä) ympäristö-altaiden (1/10 vs. 6/15), mutta ne, ympäristö-altaiden, jotka eivät ole yleensä ole suurta merkitystä, lukuun ottamatta maaperän laakeri jäykkäkouristus itiöt.
  • Useimmat lauhkean sairauksia (12/15) ovat akuutti sijaan hidas, krooninen tai piilevä: potilas joko kuolee tai palauttaa yhden tai useita viikkoja. Harvempi (P = 0,01) trooppisista sairauksista on akuutti: 3/10 kestää yhden tai kahden viikon ajan, 3/10 kestää viikoista kuukausiin tai vuosiin ja 4/10 kestää monta kuukautta tai vuosikymmeniä.,
  • hieman suurempi osuus sairauksia (P = 0,08, NS) kuuluu Vaihe 5 (tiukasti rajoitu vain ihmisiin) lauhkean alueilla (10/15 tai 11/15) kuin tropiikissa (3/10)., Vähäisyys Vaiheessa 2 ja Vaiheessa 3 sairauksia (yhteensä vain 5 tällaisia sairauksia) listallamme 25 tärkeimmät ihmisen sairauksia on huomionarvoista, koska jossain Vaiheessa 2 ja Vaiheessa 3 taudinaiheuttajien (kuten pernarutto ja Ebola) ovat tunnetusti elinvoimaiset, ja koska teoreettiset syyt ovat usein pitkälle (mutta myös kiisti) miksi Vaihe 5 mikrobeja, joilla on pitkä historia sopeutumista ihmiset on taipumus kehittyä alhainen sairastuvuutta ja kuolleisuutta ja ei aiheuta merkittäviä sairauksia. Käsittelemme tätä tulosta koskevia selityksiä täydentävässä huomautuksessa S5.,

Suurin osa (10/15) lauhkean sairauksia, mutta mikään trooppisia sairauksia (P < 0.005), ovat ns. yleisö tartuntatautien’ (asterisked Täydentävä Taulukko S1), määritellään niistä tapahtuu paikallisesti kuin lyhyt epidemia ja pystyy jatkuvan alueellisesti vain suurille väestöryhmille. Tämä ero on välitön seuraus erot lueteltu edellisessä viisi kappaletta., Jos tauti on akuutti, tehokkaasti tarttua, ja nopeasti lähtee sen uhri joko kuollut tai muuten talteen ja immuuni uudelleen infektio, epidemia pian pakoputkia paikallisen uima-allas altis mahdollisia uhreja. Jos lisäksi tauti on rajoittunut ihmisiin ja ole merkittävä eläinten ja ympäristön säiliöt, ehtyminen paikallinen uima-allas mahdollisten uhrien pieni, harva ihmisen väestöstä tuloksia paikallinen lopettamisesta-epidemia., Jos, kuitenkin, ihmisen väestöstä on suuri ja tiheä, tauti voi jatkua levittämällä tartuttaa ihmisiä lähialueilla, ja palaa sitten alkuperäiseen alueella myöhemmin vuonna, kun syntymät ja kasvu ovat uusiutuneet uuden sadon aiemmin valottamattomat ei-immuuni mahdollisia uhreja., Empiirinen epidemiologiset tutkimukset taudin pysyvyys tai katoaminen eristetty väestöryhmille eri koot ovat tuottaneet arviot väestön tarvitaan ylläpitämään väkeä tauti: vähintään useita satoja tuhansia ihmisiä tapauksissa, tuhkarokko, vihurirokko ja hinkuyskä (Anderson ja May, 1991; Dobson ja Carper, 1996). Mutta väestöryhmille, että koko ei ole missään maailmassa, kunnes jyrkkä nousu ihmisen numerot, joka alkoi noin 11 000 vuotta sitten maatalouden kehittämiseen (Bellwood, 2005; Diamond, 1997)., Siksi lauhkean vyöhykkeen joukkoepidemiataudit ovat varmasti kehittyneet siitä lähtien.

tämä ei tietenkään tarkoita sitä, että ihmisten metsästäjä-keräilijäyhteisöiltä puuttuisi tartuntatauteja. Sen sijaan, kuten harva asutus meidän kädellinen sukulaisia, he kärsivät tartuntataudit, joiden ominaisuudet sallii ne jatkuvat pienet populaatiot, toisin kuin yleisö tartuntatautien., Nämä ominaisuudet ovat: esiintyminen eläinten altaiden sekä ihmisillä (kuten keltakuume); epätäydelliset ja/tai ei-kestävä immuniteetti, joka mahdollistaa talteen potilaat jäävät allas potentiaalisia uhreja (kuten malaria); ja hidas tai krooninen, jolloin yksittäisten potilaiden jatkaa tartuttaa uusia uhreja yli vuoden, eikä vain viikon tai kaksi (kuten Chagasin tauti).

patogeeni origins. (KS. kunkin taudin yksityiskohdat lisähuomautuksessa S10)., Nykyiset tiedot viittaavat siihen, että 8 15 leuto sairauksia, jotka todennäköisesti tai mahdollisesti saavuttanut ihmisten kotieläimiä (kurkkumätä, influenssa, tuhkarokko, sikotauti, hinkuyskä, rotavirus, isorokko, tuberkuloosi); kolme muuta todennäköisesti saavuttanut meidät apinoista (hepatiitti B) tai jyrsijöitä (rutto); ja neljä muuta (vihurirokko, syfilis, jäykkäkouristus, lavantauti) tuli vielä tuntemattomista lähteistä (ks. Täydentävä Huomautus S6). Näin ollen nousu maatalouden alkaen 11 000 vuotta sitten toistaa useita rooleja kehityksessä eläinten taudinaiheuttajia ihmisen taudinaiheuttajien (Diamond, 1997; Timantti, 2002; McNeill, 1976)., Nämä roolit mukana sekä sukupolven suuri väestöryhmille tarpeen kehitys ja pysyvyys ihmisen joukosta sairauksia, ja sukupolven suuret populaatiot kotieläimiä, joita viljelijöiden tuli paljon lähempänä ja useammin yhteyttä kuin metsästäjä/keräilijöitä oli villieläinten kanssa. Lisäksi, kuten kuvittanut influenssa A, nämä kotimaan eläinten karjat toimi tehokkaasti putket taudinaiheuttaja siirrot luonnonvaraisista eläimistä ihmisiin, ja prosessi voi olla kehittynyt erikoistunut yleisö sairauksien omia.,

Se on mielenkiintoista, että vähemmän kuin trooppinen leuto taudinaiheuttajia peräisin kotieläimet: ei enemmän kuin kolme kymmenestä trooppisten sairauksien Täydentävä Taulukko S1, ja mahdollisesti ei (ks. Täydentävä Huomautus S7). Miksi lauhkeat ja trooppiset ihmisten taudit eroavat niin selvästi eläinperäisyydeltään? Monet (4/10) trooppiset taudit (AIDS, dengue-kuume, vivax malaria, keltakuume), mutta vain 1/15 leuto sairauksia (hepatiitti B) on villi kädellisillä, alkuperä (P < 0.04)., Tämä johtuu siitä, vaikka kädelliset eläimet ovat useimmat liittyvät läheisesti ihmisiin ja siten aiheuttaa heikoin laji esteitä taudinaiheuttaja siirto, valtaosa kädellisten lajien on trooppinen sijaan leuto. Päinvastoin, harvat trooppinen, mutta monet lauhkean sairauksia syntyi kotieläimiä, ja tämä on, koska kotimaan eläimet elävät pääasiassa lauhkean alueilla, ja niiden pitoisuus on aiemmin jopa enemmän lop-sided (katso lisähuomautus S8).,

lopullinen huomionarvoista noin eläinten-on peräisin ihmisen taudinaiheuttajia on, että lähes kaikki syntyi taudinaiheuttajia muita lämminveristen selkärankaiset, lähinnä nisäkkäät plus kaksi tapausta (influenssa A ja lopulta falciparum malaria) lintuja. Tämä ei tule yllätyksenä, kun otetaan huomioon fylogeneettisen etäisyyden aiheuttama taudinaiheuttajan kulkeutumisen este (laatikko A16-2). Ilmaus tämä este on, että kädelliset ovat vain 0,5% kaikista selkärankaisten lajia, mutta ovat vaikuttaneet noin 20% suurimmista ihmisten sairauksien., Ilmaistu toisella tavalla, useita merkittäviä ihmisen sairauksien osaltaan, jaettuna eläinten lajien taksonominen ryhmä edistää näiden sairauksien, on noin 0,2 apinoita, 0.017 varten kädellisten muut kuin apinat, 0.003 nisäkkäiden, muiden kuin kädellisten, 0.00006 varten selkärankaisten muut kuin nisäkkäät, ja joko 0 tai muu 0.000003 (jos kolera todella tuli vedessä elävät selkärangattomat) muiden eläinten kuin selkärankaiset (katso lisähuomautus S9).

Geographic origins. Ylivoimaisessa määrin tässä analysoidut 25 suurta ihmispatogeenia ovat peräisin Vanhasta maailmasta., Sillä oli suuri historiallinen merkitys, koska se helpotti uuden maailman (Amerikkojen) Euroopan valloitusta. Paljon enemmän Native Amerikkalaiset vastustavat Euroopan siirtolaiset kuoli äskettäin käyttöön Vanhan Maailman sairauksia kuin miekka ja luoti haavoja., Ne näkymättömät aineet Uuden Maailman valloitus olivat Vanhan Maailman mikrobeja, jotka Eurooppalaiset olivat sekä joitakin hankittu immuniteetti perustuu yksilön altistuminen ja joitakin geneettinen resistenssi perustuu väestön altistuksen ajan, mutta joka aiemmin valottamattomat Native Amerikan väestöille ei ollut koskemattomuutta tai vastus (Crosby 1986; Diamond, 1997; McNeill, 1976; Ramenofsky, 1987). Sen sijaan ei ole verrattain tuhoisia sairauksia odotettu Eurooppalaiset Uudessa Maailmassa, joka osoittautui suhteellisen terveellinen ympäristö Eurooppalaisille, kunnes keltakuume ja malaria Vanhan Maailman alkuperä saapui (McNeill, 2006).,

miksi patogeenien vaihto vanhojen ja uusien maailmojen välillä oli niin epätasa-arvoista? Analysoiduista 25 suurimmasta ihmisen taudista Chagasin tauti on ainoa, joka on selvästi saanut alkunsa Uudesta maailmasta. Kaksi muut, syfilis ja tuberkuloosi, keskustelu on ratkaisematta: se on edelleen epävarma jossa pallonpuoliskolla kuppa alkunsa, ja onko tuberkuloosin alkunsa itsenäisesti sekä pallonpuoliskon tai oli tuonut Amerikan Eurooppalaiset. Rotaviruksen, vihurirokon, jäykkäkouristuksen ja pilkkukuumeen maantieteellisestä alkuperästä ei tiedetä mitään., Kaikkien muiden 18 suuren taudinaiheuttajan kohdalla vanhan maailman alkuperä on varma tai todennäköinen.

aiempi keskustelu ihmispatogeenien eläinperäisestä alkuperästä saattaa osaltaan selittää tätä epäsymmetriaa. Enemmän leuto sairauksia syntyi Vanhassa Maailmassa kuin Uuden Maailman, koska paljon enemmän eläimiä, jotka voisi toimittaa esi taudinaiheuttajia olivat kesyjä Vanhassa Maailmassa. Maailman 14 tärkeimpien lajien kotimaisten nisäkkäiden karjan, 13, mukaan lukien viisi runsaimmat lajit, joiden kanssa olemme tulleet lähinnä yhteyttä (lehmä, lammas, vuohi, sika ja hevonen), on peräisin Vanhan Maailman (Diamond, 1997)., Ainoa eläinlaji kesyjä Uusi Maailma oli laama, mutta se ei ole tiedossa, on tartunnan meille mitään taudinaiheuttajia (Diamond, 1997; Dobson, 1996)—ehkä siksi, että sen perinteinen maantieteellinen alue rajoittui Andes, se ei lypsänyt tai ratsastetaan tai naimisiin aurat, ja se ei cuddled tai pitää sisätiloissa (kuten jotkut vasikat, karitsat ja porsaat)., Yksi syy, miksi paljon enemmän trooppisia tauteja (yhdeksän vastaan yksi) syntyi Vanhassa Maailmassa kuin Uusi Maailma on, että geneettinen etäisyys ihmisten välillä ja Uuden Maailman apinat on lähes kaksinkertainen, että ihmisten välillä ja Vanhan Maailman apinat, ja on monta kertaa, että välillä ihmisten ja Vanhan Maailman apinat; ja niin paljon enemmän evoluution aikaa oli käytettävissä siirrot eläimistä ihmisiin Vanhassa Maailmassa (noin 5 miljoonaa vuotta) kuin Uudessa Maailmassa (noin 14 000 vuotta).